自動啟停系統故障的原因有以下幾種：

1、原因一:一般配有自動啟停功能的車輛都是預設開啟啟停系統的，突然不能用，有可能是誤按了車上的自動啟停按鍵，導致系統關閉。我們檢查下系統是否被關閉；

2、原因二，如果你的車是手動擋的汽車，那自動啟停的啟用條件會比較複雜一點，當我們停車的時候，當系統識別到"掛空擋，拉手剎，松離合，"這三個動作後才會啟動；

3、原因三，各個品牌的不同車型，自動啟停系統的設計也不同，以新Passat的自動啟停系統為例，它必須要滿足一定條件。即必須要安全帶繫上，然後第二個左前門要關閉，發動機要在啟動，所以看看你的使用手冊有沒有什麼注意事項；

4、原因四，以下這些情況下不會啟動該功能，發動機未達到正常工作溫度、自動空調未達到預設溫度、電瓶儲電量不夠、停車後轉動方向、車輛緊急剎車、倒車，大家可以參考以上幾點；

5、原因五，自動啟停系統故障，可能是因為線路，也有可能是其它原因導致啟停系統工作實效，這時候最好到4S店進行檢修。