生活在維多利亞時代的女孩溫迪，出生在壓抑的環境中，還整天被一個呆板頑固的父親，扼殺她童年的快樂和夢想。溫迪的好朋友約翰和米高，也遭受著同樣的痛苦，他們夢想著有一天，能夠學會在天上飛，這樣他們就可以飛離令他們討厭的家了。

終於有一個黑暗的夜晚，長著乳牙的小飛俠彼得·潘，飛到了他們的窗前，說要教會他們飛翔，帶他們去一個美麗的地方。溫迪、約翰和米高都高興極了，於是，他們很快就跟著小飛俠學會了飛，而且飛到了一個美麗的海島——夢幻島。

原來，小飛俠是夢幻島上永遠也長不大的調皮小孩，他和小仙子一起生活在這個島上，但兩個人覺得多少有點寂寞，於是就請來了雲蒂他們三個夢想飛的人類小孩。

飛到夢幻島，溫迪立刻被這個美麗而神秘的海島吸引住了，這裡有茂密的叢林、高大的樹木，還有野蠻的印第安人，以及橫行附近海面的壞蛋海盜。小飛俠帶著溫迪他們找到了六、七個隱蔽的樹洞，這就是他們在夢幻島上的家，平時他們在海盜的深處探險，晚上累了就回到樹洞休息遊戲。

溫迪、約翰和米高本來可以在夢幻島開心地嬉戲玩樂，和小飛俠與小仙女兩位神秘朋友快樂的生活，優哉遊哉，豈料，無惡不作的海盜鐵鉤船長帶著他的一幫海盜前來大肆破壞。勇敢的小飛俠，這次要營救他的好朋友離開夢幻島，為此他們展開了一系列奇妙的冒險之旅。