中俄邊境條約的主要內容有：

1、俄國將伊犁地區歸還中國，中國將霍爾果斯河以西、伊犁河南北一帶地方劃歸俄有，根據本約規定的界線，在塔爾巴哈臺地區酌定新界，在喀什噶爾地區“照兩國現管之界勘定、安設界牌”；

2、中國賠款900萬銀盧布（約合509萬兩白銀），限兩年內償清；

3、俄商在蒙古地區貿易照舊免稅，在新疆各城貿易“暫不納稅”，準俄商前往肅州（即嘉峪關）貿易，由俄國運入該處的貨物，按舊例減稅三分之一；

俄商販貨由陸路運入中國，可照舊經張家口、通州前赴天津，或由天津運往別口和內地市場銷售。俄人可以在設領各城及張家口建造鋪房、行棧；

另據中俄《改訂陸路通商章程》，陸路商路除恰克圖至天津一路外，增闢尼布楚—張家口—天津及科布多—張家口—天津兩條新線。俄商所往通商路線各處如通州等也准許銷售貨物，所有完納稅餉等事，均按新章辦理，俄商來蒙古、新疆貿易的過境卡倫增至35處；

4、俄國得在肅州、吐魯番兩處增設領事，科布多、烏里雅蘇臺、哈密、烏魯木齊、古城五處，“俟商務興旺”後陸續添設領事，俄國領事官有權與中國地方官“公同查辦”兩華人民在中國境內發生的一切事端；

5、伊犁居民願遷居俄國入俄國籍者，均聽其便，中國官員不得攔。