根系施肥的方式有環狀溝施、條狀溝施、放射狀溝施、穴施、全園施肥、打眼施肥等。

（1）環狀溝施：在樹冠外圍挖一條20-40釐米寬，15-45釐米深環狀溝，然後將表土和基肥混合施入，此法適全於幼齡柑橘園。

（2）條狀溝施：在柑橘園行間挖1-2條寬50釐米，深40-50釐米的長條形溝，然後施肥覆土，此法適用於長方形栽植的成年柑橘園。也可在行間或株間挖幾條寬20釐米左右，深15-30釐米，長較樹冠冠幅略長的條狀溝施肥。

（3）放射狀溝施：在距樹幹1米遠的位置，挖5-6條放射溝，溝寬30-50釐米，深15-40釐米，長度抵樹冠外緣。肥料施入溝中覆土，此法適用於成年柑橘園，尤適梯面較窄的柑橘園施肥。

（4）穴施：在樹幹1米以外的樹冠下，均勻挖10-20個深為40-50釐米，上口直徑25-30釐米，底部直徑5-10釐米的錐形穴，穴內塞入枯草等，用薄膜蓋口，追肥灌水盡在穴內。此法適用於保肥保水性差的沙土柑橘園。

（5）打眼施肥：即在樹冠下用土鑽打土眼，將肥料稀釋灌入洞眼中，讓肥水慢慢滲透，此法用於密植柑橘園和雨水較少地區的成年柑橘園。

（6）全園施肥：將肥料均勻撒佈於全園，然後翻耕，使肥料入土，深度以20釐米左右為宜，此法適用於根系密佈全園的成年柑橘園或密植園