造成黃瓜定植後死棵的原因很多，有擬莖點黴根腐病、蔓枯病、菌核病等導致的死棵，也有因肥水不當引起的死棵，還有因為久陰驟晴導致的死棵死苗。

黃瓜屬葫蘆科一年生草本植物，是淺根性作物，分為主根、側根、鬚根和不定根。根生長快，播後6周主根入土深約0.1米，主根群分佈在7～30釐米的耕層內，吸收肥水的範圍小，不耐旱。黃瓜根系的這種淺生性大半與它的好氣性和好溼性有關。一般生產上“ 黃瓜漏脖，茄子沒脖”的栽培措施符合黃瓜的生長特性。

黃瓜根的呼吸能力強，表層土壤空氣含量多，有利於根系生長。土壤溼度85％～95％，土壤含氧量在5％以上，則適於根系的活動。所以栽培上要選擇透氣良好的沙質壤土，而不宜用黏重的土壤。要使用腐熟的有機肥料，保持土壤適宜的溼度，才能利於根系的良好發育。黃瓜定植宜淺，定植後要多次中耕鬆土，一方面可以提高地溫，另一方面增加土壤的滲透性，有利於根系生長。

除了土壤溼度與含氧量之外，黃瓜根系對地溫也比較敏感。育苗期要特別注意溫度管理，地溫低於12℃則無法生長，長時間低於10℃要發生寒根，黃瓜根系生長的適宜溫度是18℃～23℃，地溫至少在15℃以上。而溫度長期處於25℃以上，就會加速根系衰老，露地夏秋茬、大中棚秋延晚茬和日光溫室秋冬茬育苗時，氣溫高，地溫也高，不利於根系生長髮育，而且極易引起根系衰老。