除草劑作為一種化學藥劑，使用時應有嚴格的條件限制，而不應該隨意使用。而且只有當施藥方法與其相關要求相符合，才能達到理想的除草效果，增加農作物的產量。當前常見的使用除草劑方法主要有對雜草的莖葉處理和土壤表層處理兩種，即莖葉處理是常見的葉面噴霧法，土壤處理可採用噴霧或撒施毒土（肥或沙）

除草劑以土壤處理的方法使用最為廣泛，有人估計約有近70%的除草劑是採用此法使用的．這是因為日雨便用的除草劑多為芽前處理劑。

土壤處理就是採用適宜的施藥方法把除草劑劑直接施於土壤表面或土壤表層中，一般用於防除由種子萌發的雜草及多年生淺根性的雜草。

將除草劑施於土表的稱為土表處理，使土壤表面形成藥膜層。施藥後不能動土，否則，將藥膜層破壞，降低除草效果。一般是在播後苗前施藥，凡是透過根或幼芽被吸收的除草劑往往採取此法使用。

將除草劑施於表土層的稱為混土處理，且口將除草劑均勻混到5~io釐米土層內，形成藥土層。雜草種子較輕，多在0.1~5毫克之間，絕大多數的雜草幼苗都是由在土表5釐米以內的種子萌發而出土的，根據雜草種子在土壤中分佈情況確定混土的深度。混土處理主要適用於易揮發或易光解的除草劑，一般是在作物播種前施藥，並立即採用圓盤耙或旋轉鋤交叉粑地，將藥劑混拌於土表層中，然後撈平、鎮壓，進行播種

用作土壤處理的除草劑，一般只感發的雜草種子有殺傷作用，對未萌發的雜草種子無效。為了充分發揮藥劑土壤處理的除草效果，施藥前後應結合耕作措施，誘發雜草種子整齊萌發出土，這在春季乾旱地區尤為重要。