熒光顯微鏡的濾光片種類有以下幾種: 1. 吸熱濾光片 吸熱濾光片是防止光源光譜中的熱輻射線損傷光具組所必需的濾光片。 2.激發光濾光片 激發光濾光片可以選擇性吸收長波譜線而吸通透紫外線，紫色，藍色和綠色光線的濾光片為激發濾色片 。3.阻擋濾光片 阻擋濾光片是選擇性吸收短波譜線和紅外線而通透較長波長可視線的濾光片，其功能是使觀察都能看到被檢物體所激發出來的熒光，同時保護觀察都的角膜免遭紫外線傷害。 4.色光分離濾光片 色光分離濾光片是將激發光反射到被檢物體上，使被檢物體激發出熒光，再將熒光透射到目鏡的濾光反射鏡。這類濾我片只能用於落射光聚光器中，而透射光熒光顯微鏡不需要色光分離。 5.干涉濾光片 干涉濾光片是高效能激發濾光片的一種。它是將數張薄層金屬膜疊放在拋光的兩張玻璃片之間製成的濾光片。每張薄金屬膜的折光係數都不相同，因此照明光源的各種不同波長的譜線在每張金屬膜上反覆進行反射，使得某些波長的譜線因相消干涉而抵消，另一些波長的譜線相加干涉而得以加強，並透射過去，這樣得到透射波譜很窄、半波峰寬度只有6-20nm，透光度可達到60% -70%的濾光片。