磷的固定是土壤磷的生物有效性降低的主要原因之一。土壤中磷的固定主要有以下幾個方面：第一是化學固定。在石灰性和中性土壤上，磷的化學固定主要由鈣鎂體系所控制，使可溶性的磷酸二鈣逐漸轉化為溶解度很小的磷酸八鈣、磷酸十鈣，從而降低了磷的有效性。在酸性土壤上，磷的化學固定由鐵、鋁體系控制，使之形成很難溶解的Fe—P或Al—P化合物，使作物不易吸收利用。第二是吸附固定。 在酸性土壤上所發生的非專性吸附，即是黏粒表面的OH-質子與磷酸根離子產生非專性吸附，而這種吸附是一種可逆反應，其反應方向與作用速度受H＋濃度控制。在Fe、Al多的土壤中易產生磷的專性吸附，這種吸附隨著時間的推移，可出現磷的“老化”，使磷肥效果大大降低。第三是磷的閉蓄態固定。 在磚紅壤、紅壤、黃棕壤和水稻土中，磷酸鹽可被溶度積很小的無定形鐵、鋁、鈣等膠膜所包蔽，這種形態的磷難以被作物利用。第四是生物固定。土壤中的微生物生長繁殖時需要吸收土壤中的無機態的磷營養，致使發生磷的生物固定。然而這種磷固定是暫時的，當微生物死亡時，它又會釋放出來。