半索動物又稱隱索動物，是一些口腔背面有一條短盲管（口索）前伸至吻內的海棲類群。有人認為，半索動物應該列入動物界中最高等的脊索動物門裡面去，因為半索動物與脊索動物的主要特徵相似，如口索、背神經索前端有空腔、有咽鰓裂。但也有人認為，半索動物的口索很可能是一種內分泌器官，其腹神經索、開管式迴圈、肛門位於身體末端等特徵與非脊索動物相似，所以另立一個獨立的門較合適。半索動物大約僅有幾十種生存種，分成2個綱：（1）腸鰓綱（如各種柱頭蟲），（2）羽鰓綱（如頭盤蟲等）。代表動物——柱頭蟲 (一)有兩條縱走的神經索 有一條腹神經索和一條背神經索.背神經索在"領"中的部分有空腔,相當於背神經管的雛形). (二)消化管前端咽壁的背側有許多對鰓裂. (三)口上方向前伸出一條短盲管——口索. (四)柱頭蟲其他特徵: 1.棲息於太平洋沿岸淺海泥沙中,生活方式與蚯蚓相似.最長的個體可以超過兩尺. 2.雌雄異體.變態發育,幼體與棘皮動物相似. 是介於脊索動物與棘皮動物之間的過渡型別.