1、殺菌的方式不同

雖然鮮牛奶和純牛奶都是以新鮮的牛乳為原料，但是純牛奶是以132℃的高溫滅菌的方法來處理，而鮮牛奶是透過85℃低溫加熱的方式來處理，所以又稱為巴氏殺菌奶。

2、保質期不同

因為鮮牛奶是經過低溫的方法來處理，所以內部還是會殘留一部分耐高溫的菌種，一般就只能儲存5-7天，而純牛奶是經過瞬間高溫加熱處理，一般會讓牛奶中的菌種全部消滅，因此保質期就要長一些，可以儲存1-3個月。

3、營養價值不同

鮮牛奶：鮮牛奶的加熱處理是巴氏消毒，溫度較低，雖時間較長，但對牛奶的營養成分損失甚小，營養價值高。

純牛奶：純牛奶經過高溫加熱處理，高溫使菌類失活的同時，也使得牛奶的部分成分發生了變化，所以營養價值不及鮮牛奶。

4、價格不同

鮮牛奶：生產鮮奶的企業要有充足的原奶，原奶可向當地牧民或奶農收購，或者企業自身擁有乳源基地，乳源基地的建設需要大量資金，所以鮮奶的價格較高。

純牛奶：較鮮牛奶低。