火車晚點的原因很多，有些固然是鐵路部門的原因，比如遇到某些排程的水平差，把客車搞得晚點，另外有時候機車或者動車發生故障導致列車晚點，還有些時候是因為線路一些裝置比如訊號這些出現了故障導致列車晚點。另外個別時候如果遇上有專運列車，所有列車都得為專運列車讓道，那也肯定會造成列車晚點，畢竟鐵路部門必須得保證專運列車正點。還有一些導致列車晚點的原因就更不該怪鐵路部門了，有時候吹大風把異物吹到了電氣化鐵路的接觸網上，或者有人放風箏結果風箏飄到電氣化鐵路的接觸網上，那也會引起電線短路而導致列車晚點，供電段還得去把異物清除，然後列車才能通行。此外一些不可抗拒因素也會導致晚點，比如出現了暴雨天氣，為了保證列車完全執行，鐵路部門要求列車限速執行，那也會晚點，但那是為了大家的安全。畢竟鐵路部門也不希望列車晚點，因為有列車晚點就有可能影響一大片列車執行，對鐵路自己也是損失，列車司機和客車上的列車員難道希望晚點嗎，人家也希望早點到站早點下班。

不應該退差價，也就是說晚點是因為特殊原因而造成的，這是自然形成的並不是說人為的所以並沒有規定說火車晚點了就要退差價的這個因為是難以預料的也是屬於正常範圍。