蓮花生大師雲：“上等為珍寶，中等為樹果，下等為木頭、土石與藥物。

”隨息、增、懷、誅四種事業的不同，所採用的材料也有所不同。譬如：息業部用水晶、貝殼、青金石、海螺等等；增業部用金、銀、象骨等等；懷業部用銅、珊瑚以及紅檀香等等；誅業部則採用夏（刺樹果）、龍堂（油患子）以及人骨等為佳。　　 　　不僅四種事業各自所用數珠的材料不同，包括其顏色，也是千差萬別的。《紅大威德續》等續部中宣說道：“息業為白色，增業為黃色，懷業常用紅，黑色為極誅。”所以，應當毫不錯亂地使用。　　 　　然而，菩提子卻不必觀待顏色之差別，而可修一切事業法。關於這一點，在經續中有眾多出處。《金剛空行續》雲：“息增懷誅業，菩提子普作。”《金剛頂續》中也雲：“復諸殊勝者，持命菩提子。”以菩提子（為數珠的唸誦功德）倍數，也比其他數珠殊勝。前譯續部雲：“鐵為珠兩倍，如是銅四倍，夏兩千萬，珍珠為八倍，寶石為千倍，銀為十萬倍，蓮子八千萬，菩提子無數。” 　　 　　此處所說的菩提子，為菩提樹之果實。但卻不一定只是類似於金剛座的菩提樹果那樣的果實。譬如，過去七佛的菩提樹都是各不相同的，有些上師說，包括那伽樹也在此列。所以，所謂菩提子，包含了所有菩提樹類樹木（的果實）。　　 　　喬美仁波切曾說過：“往昔讓雄瓦尊者在世時，一次念珠（因線斷）而灑落於地，其中有些珠子因此而丟失不見了。當時恰好有一老婦在場，（尊者於是委託老婦）妥為關照，並授記道，這些灑落於地的珠粒，於不久之後，將長出樹木果實。這類菩提樹，世世代代將由老婦人的子孫後代管屬。此樹也屬於菩提樹家族。”與此相似的，在降域等地長出的菩提子，也是世人所說的菩提子。　　 　　還有，所謂不如法的數珠，就是指從違越誓言者、持邪見者、造作無間罪者、劊子手(屠夫)、骨肉相殘者、盜賊等人手中得來，以及自己從別人手中搶奪而來的、他人丟失的、取自於佛像裝飾品的、被火燒焦、(珠子)類別不同、形狀大小不一、破損等情形的數珠。總而言之，凡是與瑜伽士意願不合的數珠，都不應該持帶。蓮花生大師雲：“以獸角與骨頭為數珠者，其加持與妙力不生（但頭蓋骨之類的念珠則為例外）。”因此，這類數珠也屬於不如法持帶數珠的範疇。