由於水體中空氣含量很少，為滿足自身生長之需，水生植物體內常具有由氣腔、氣囊、氣道等組成的發達的通氣組織。這些通氣組織可以將空氣順利地運輸、儲藏到水生植物體內的各個器官和組織，供給光合與呼吸作用，從而滿足植株的正常生理活動。有些水生植物還具有氣生葉或飄浮葉。漂浮葉僅在上表皮具有氣孔，葉肉中也有發達的通氣組織。雨久花科、鳳眼蓮屬的水葫蘆就很值得一提。水葫蘆又名鳳眼蓮、水浮蓮等，是多年生漂浮植物。它的莖短縮，基生葉排列成蓮座狀，葉柄的中下部膨大，內部是結構疏鬆的通氣組織。這葫蘆狀的葉柄就是氣囊，既利於植株漂浮在水面，更能保證它們的呼吸。水鱉科、水鱉屬的水鱉也是多年生飄浮植物。在它們圓狀心形或近腎形的葉片背面也具有寬卵形的泡狀貯氣組織。大家非常熟悉的蓮，是睡蓮科、蓮屬多年生挺水植物。藕是它們的根狀莖，膨大的節間內部縱行通氣孔道通暢發達，並與中空的葉柄通連。這種特殊構造正是它們在淤泥中呼吸的保證。就連花托在傳粉受精後都膨大發育成海綿質蓮蓬，內藏多數小堅果(蓮子)。這種構造既適於種子漂流傳播，又能保證果實種子的呼吸。還有多年生挺水植物香蒲，是香蒲科、香蒲屬植物。如果撕開它們扁平帶狀的葉片，就會看到其葉片的內部也是疏鬆的通氣組織。