1、黃土、沙土果園的土壤貧瘠，鋅含量較低，或者因為土壤有較好的滲水性，因為澆灌了太多的水而造成土壤中的可溶性鋅鹽流失。

2、施用過多的磷肥，造成果樹對鋅有更高的需求量。

3、石灰性與鹽鹼性土地中的鋅更容易被固定，無法完全被果樹的根系所吸收。

4、土壤黏性較重，活土層不深，果樹的生長髮育根系不健全。

5、重茬果園或者苗圃地內種植蘋果樹容易出現缺鋅病的情況。

其它原因導致蘋果小葉，基本都是因葉芽養分不足，生長不良，出現小葉現象。

6、修剪不當：（1）強行拉枝會使枝條木質部內維管束受傷，影響養分運輸，葉芽營養少，導致生長受阻，出現小葉現象。（2）修剪傷口過大或過多時，養分集中運輸至傷口，促進傷口癒合，傷口前端枝條因營養供給不足，使葉芽缺乏發芽動力，從而導致小葉。

7、凍害：果樹枝條受凍多為秋梢。受凍秋梢一般都是沒有采取秋梢控制措施或秋末澆水過多，秋梢生長旺盛，入冬沒有達到老化，因寒冬季節受凍開春營養迴流困難而導致營養不足形成小葉。

8、枝幹病害：腐爛病、輪紋粗皮病、幹腐病等病害嚴重危害到樹幹或樹枝，會影響到樹皮組織對營養的運輸，養分迴圈能力差。受損枝幹對應的新梢生長力弱時，也會出現小葉現象。