酒後身體痠痛的原因其實很簡單，其本質和鍛鍊後肌肉痠痛是一個道理，我們知道鍛鍊後由於肌肉內乳酸生成過多，不能及時被分解代謝，而乳酸對神經有刺激作用，從而產生一段時間內的肌肉痠痛。飲酒後的痠痛同樣是乳酸刺激神經引發的，而為什麼飲酒會導致乳酸生成過多，這點涉及到生物化學的知識。

首先酒精在人體內會被酶進行代謝分解，而無論是專屬的酒精代謝酶，還是微粒體混合功能氧化酶，在把乙醇代謝為乙醛以及乙酸的過程中都是氧化反應，當然這個氧化反應不是無機化學中的和氧氣反應，而是有機化學中的脫氫反應。

由乙醇或者乙醛進行脫氫反應時所脫下來的氫需要載體，在我們體內主要是由NAD（氧化型尼克醯胺腺嘌呤二核苷酸）進行氫的攜帶，也就是說在酒精代謝的過程中會生產大量的NADH（還原型NAD），NADH是體內重要的供氫體，會把氫帶給需要的反應物。

而體內的乳酸其實是葡萄糖無氧酵解的最終產物，是由丙酮酸轉變而來，丙酮酸既可以轉變為乳酸，也可以進一步轉變為乙醯輔酶A從而進入三羧酸迴圈進行有氧氧化，但是這裡存在三個情況導致葡萄糖的代謝會向生成乳酸偏向。第一是NADH是丙酮酸像乳酸轉移的供氫體，第二是NADH是三羧酸迴圈中檸檬酸合酶的抑制劑，可以導致迴圈減緩，從而讓更多的草醯乙酸及乙醯輔酶A堆積，從而導致丙酮酸向乙醯輔酶A轉移受阻。第三是乙醇最終代謝物就是乙醯輔酶A，這同樣會減少丙酮酸的有氧氧化。

種種原因就會導致飲酒後，尤其是大量飲酒後乳酸堆積，從而造成肌肉痠痛。