中國第一歷史檔案館儲存清代歷史檔案共約1200餘萬件（冊），其中完好、比較完好，能夠提供社會利用的約1000餘萬件（冊），殘破、嚴重殘破，暫無法提供利用的約200餘萬件（冊）。在能夠提供利用的1000餘萬件檔案中，漢文件案有800餘萬件（冊），滿文件案約200餘萬件（冊），另有蒙文檔案5多件（冊），還有少量藏文、維吾爾文、託忒文等少數民族文字及英、日、俄、德、法等外國文字的檔案。檔案時間，從清入關前之天命前九年（1607），至宣統三年。另有溥儀退位後1912年至1924年未出宮前以及其在天津、東北時的檔案。
和全國地方各級檔案館、圖書館所存清朝檔案比，這些檔案最大的特點，一是絕大部分檔案是清朝中央國家機關的官文書和清朝皇家的檔案，只有極少部分是地方政權機關和個別重要人物的全宗檔案。二是檔案內容，涵蓋了有清一代國家政治、經濟、軍事、文化、民族、宗教、天文、地理、外交事務、重大歷史事件、重要典章制度、重要歷史人物等各個方面。
這些檔案按文種劃分，有一百多個文種，大致可分為四類：
1、皇帝下達的制辭、詔書、誥命、敕諭、硃諭、上諭、旨述及硃批等詔令文書。
2、各省總督、巡撫等地方官員及各部、院衙門大臣上奏的題、奏、表、箋等奏章。
3、各衙門之間在辦理各種公務中形成的諮、呈、稟、詳及移會、移付、知照、函、札等來往文書。
4、清政府彙編存查的各種方略、史書、實錄、聖訓及記載各衙署日常公務的各種檔簿清冊。
按檔案形成的機構劃分，共分為73個全宗。即：
內閣、軍機處、宮中各處、內務府、宗人府、吏部、戶部、禮部、兵部、刑部、工部、陵寢禮部、外務部、學部、農工商部、民政部、巡警部、郵傳部、樂部、理藩院、弼德院、都察院、大理院、資政院、翰林院、國子監、欽天監、會議政務處、督辦鹽政處、總理練兵處、北洋督練處、清理財政處、管理前鋒護軍等營事務大臣處、稅務處、侍衛處、尚虞備用處、京城巡防處、京城營務處、大清銀行、禁衛軍、京城善後協巡總局、禁菸總局、憲政編查館、修訂法律館、國史館、方略館、太僕寺、太常寺、光祿寺、鴻臚寺、神機營、健銳營、火器營、會考府、軍諮府、順天府、醇親王府、近畿陸軍各鎮督練公所、京師高等審判廳、檢查廳、長蘆鹽運使司、八旗都統衙門、步軍統領衙門、山東巡撫衙門、黑龍江將軍衙門、寧古塔副都統衙門、琿春副都統衙門、阿拉楚克副都統衙門及溥儀檔、端方檔、醇親王檔、趙爾巽檔和輿圖彙集。
中國第一歷史檔案館儲存清代歷史檔案共約1200餘萬件（冊），其中完好、比較完好，能夠提供社會利用的約1000餘萬件（冊），殘破、嚴重殘破，暫無法提供利用的約200餘萬件（冊）。在能夠提供利用的1000餘萬件檔案中，漢文件案有800餘萬件（冊），滿文件案約200餘萬件（冊），另有蒙文檔案5多件（冊），還有少量藏文、維吾爾文、託忒文等少數民族文字及英、日、俄、德、法等外國文字的檔案。檔案時間，從清入關前之天命前九年（1607），至宣統三年。另有溥儀退位後1912年至1924年未出宮前以及其在天津、東北時的檔案。
和全國地方各級檔案館、圖書館所存清朝檔案比，這些檔案最大的特點，一是絕大部分檔案是清朝中央國家機關的官文書和清朝皇家的檔案，只有極少部分是地方政權機關和個別重要人物的全宗檔案。二是檔案內容，涵蓋了有清一代國家政治、經濟、軍事、文化、民族、宗教、天文、地理、外交事務、重大歷史事件、重要典章制度、重要歷史人物等各個方面。
這些檔案按文種劃分，有一百多個文種，大致可分為四類：
1、皇帝下達的制辭、詔書、誥命、敕諭、硃諭、上諭、旨述及硃批等詔令文書。
2、各省總督、巡撫等地方官員及各部、院衙門大臣上奏的題、奏、表、箋等奏章。
3、各衙門之間在辦理各種公務中形成的諮、呈、稟、詳及移會、移付、知照、函、札等來往文書。
4、清政府彙編存查的各種方略、史書、實錄、聖訓及記載各衙署日常公務的各種檔簿清冊。
按檔案形成的機構劃分，共分為73個全宗。即：
內閣、軍機處、宮中各處、內務府、宗人府、吏部、戶部、禮部、兵部、刑部、工部、陵寢禮部、外務部、學部、農工商部、民政部、巡警部、郵傳部、樂部、理藩院、弼德院、都察院、大理院、資政院、翰林院、國子監、欽天監、會議政務處、督辦鹽政處、總理練兵處、北洋督練處、清理財政處、管理前鋒護軍等營事務大臣處、稅務處、侍衛處、尚虞備用處、京城巡防處、京城營務處、大清銀行、禁衛軍、京城善後協巡總局、禁菸總局、憲政編查館、修訂法律館、國史館、方略館、太僕寺、太常寺、光祿寺、鴻臚寺、神機營、健銳營、火器營、會考府、軍諮府、順天府、醇親王府、近畿陸軍各鎮督練公所、京師高等審判廳、檢查廳、長蘆鹽運使司、八旗都統衙門、步軍統領衙門、山東巡撫衙門、黑龍江將軍衙門、寧古塔副都統衙門、琿春副都統衙門、阿拉楚克副都統衙門及溥儀檔、端方檔、醇親王檔、趙爾巽檔和輿圖彙集。