兩個的底層架構完全不一樣，雖然Linux也有Gnome、KDE等GUI介面，但是源於Unix的底層明顯比Windows要穩定的多。現在像SAP用Redhat, Suse Enterprise來作為服務平臺。

其實國外用Linux的生態環境要好於國內。國內絕大多數使用者還是在用Windows或Mac，所以現在這兩個平臺在國內有廣大的應用市場，而Linux就要少很多。

Windows與Linux的不同，從以下幾個維度:

1. 使用者體驗: 儘管Linux也有Ubuntu, RedHat等帶圖形介面的發行版，但是主流使用者還是以專業人士為主，更多習慣用Shell script/ command來操作；Windows的大部分使用者，都習慣了在視窗模式下操作。

2. 核心架構: Linux是宏核心設計，Windows是微核心設計。

下面從幾個典型子系統進行對比:

(1)圖形子系統:

Linux上的圖形子系統實際上是一個使用者態程序，而Windows的圖形子系統大部分位於核心態，屬於核心的一部分，這樣的設計也是為了追求更好的圖形效能；Windows採用微核心設計，所以各個子系統之間透過訊息進行互動。

(2)網路子系統:

Linux的網路子系統採用傳統的TCP/IP協議棧加上Socket來實現，而Windows上採用分層更詳細的NDIS架構。

(3)檔案子系統:

Linux上支援FAT32、Ext2等多種檔案系統，而Windows上主要支援微軟NTFS檔案系統

3. 驅動程程式開發與形態:

現代Linux驅動程式的主流開發模式採用模組式，Windows上95/98採用VxD, 2000/XP採用WDM, Windows 7之後採用UMDF和KMDF。

4. 開發除錯工具:

Linux上主要用GCC/GDB/DD等，Windows上用Visual Studio/WinDBG等

5. 可執行程式檔案格式:

Linux上以ELF為主，Windows上以PE為主

6. 用途:

Linux主要用作伺服器和工作站，Windows主要用於個人計算機。

先說windows吧，這個作業系統適合普通電腦使用者，操作簡單，很多基本上面向大眾的遊戲或者軟體都是在windows執行的，windows有一個登錄檔，用來記錄系統資訊的，所以windows的操作是非常簡單的，但是又是因為簡單的原因windows安全性是非常低的，所以伺服器很多都是選用Linux。Linux的服務類系統基本是基於終端操作都是命令列，因為圖形化介面會佔用CPU，所以伺服器選用只安裝命令列操作。這是操作方面的巨大差別。

其實Linux的圖形化介面製作的也是非常好看的，比如我現在使用的parrot，圖形介面非常炫酷，發行量這個細微的地方就可以感受到他們之間的巨大差別，Linux是開源系統，發行量巨大，而且Linux開源但是並不代表免費，一些服務需要收費，但是大多數還是免費的。windows就不同這是一個收費的系統，就算使用都需要付費。這也算一個比較大的差別吧。