《大魚海棠》主要講述了一個居住在“神之圍樓”裡的女孩名叫椿，十六歲生日那天她到人間去參與成人禮的巡遊，意外結識了人類男孩鯤。為了還清所欠下他的，椿回到“其他人”的世界後，拿自己所有換了一個願望，並和青梅竹馬的夥伴湫在他們的世界展開了一場冒險。 故事發生在一個與人間平行的新世界。新世界的天空，與人間的海洋相連。他們不是人，他們是“其他人”。他們為神工作。他們的世界，處處都是神蹟，人人都是神使。有人掌管風，有人掌管水，有人掌管火，有人掌管萬物生長，有人掌管靈魂之生滅。三百年後，他們壽終，化作星辰，即為永生。 椿和湫便在這裡長大。椿掌管海棠花開，湫掌管秋風。椿在一次成人禮中出現意外，被一位人間少年所救，少年因為她失去生命。椿為了報答少年，開始了報恩之旅。湫為了守護椿，獻出了自己的生命。 椿用自己一半的靈魂換回了少年的靈魂-- 一條小魚，其名為鯤。椿想將其養大放回人間，卻不知此行徑有違天命，給自己的家鄉帶來了災難。最後，還是在椿、湫和椿的爺爺奶奶幫助下，他們回到了人間。 據悉，《大魚海棠》是一部比較虐心的影片，結局椿和湫並沒有在一起。湫犧牲了自己，讓椿和鯤重返人類世界相見。 八千年是一個輪迴，他們的故事還將會繼續，只是成為了靈婆接班人的湫再也贖回不了他的椿，這就是整個故事最虐心的地方。

劇情荒誕與結局動人並無直接的關係。

荒誕是你覺得這個內容很不真實，或者是有一些內容你看不懂，因為這個電影隱藏的劇情有很多，如果你看不出它的隱藏劇情的話你就會覺得這個內容讓人很無厘頭。

結局令人感動是因為最後的椿為了大家犧牲了自己而湫為了椿犧牲了自己。人們往往會因為這一些善良的舉動而感到感動，尤其是以生命和自由為代價時。結局令人感動的第二個原因是因為（在我看來是這樣）我覺得那個男孩只是在救椿的時候失去了生命，他當時只是出於自己內心的善良，而湫是出於對椿的愛，並且一直都在陪伴著椿，幫助著椿，所以我想應該很多人都希望椿與湫能夠在一起。對於湫，當愛而不得的時候，卻能夠為了愛而獻出自己的自由並且成全別人，明明是一個凌駕於萬人之上的天神最後卻為了愛而成為了下一任靈婆，這樣的結局著實讓人感動。