我覺得有一下幾個下場:

1.以當時的局勢分析投靠李世民是明智之舉。

因為秦王李世民招賢納士，求賢若渴，禮賢下士，招募各路英雄豪傑收入自己賬下。

2.李世民是文武雙全，志向遠大，絕非“池中物”，不會久居人下。

3.李世民的威望和聲譽很好，讓很多英雄豪傑慕名前來投靠，所以他會籠絡人心.招兵買馬.收買人心。

4.因為投靠李世民，他們可以博取一個好的容身之所，前途充滿希望。

5.當時天下大勢李唐王朝已佔大部，李唐王朝完成天下一統指日可待。

6.如果不投靠李世民，他們將會是一群烏合之眾翻不起多大的浪。而且會被消滅。

7.如果不投靠李世民，他們的下場將會很悽慘，晚景淒涼。

瓦崗的秦瓊，程咬金，侯君集，徐茂公這些投靠李世民，就是因為看到打不過才投降的。如果打得過他投降個屁。李世民還算有氣量的，不然投降的機會都不會給他們就直接全部滅了

瓦崗軍是隋末農民起義中舉義較早、發展最快、勢力最強大的三大義軍之一。

①東郡翟讓首舉義旗，濟陰郡單雄信、徐世績等人投奔翟讓。瓦崗軍在汴水所經的滎陽郡和梁郡邊界，奪取公私行舟的貨物，殺富濟貧，多次成功反隋軍圍剿，隊伍發展到1萬多人，成員以貧苦農民和漁獵手為主。

②隋朝貴族上柱國、蒲山公李寬之子李密在反隋失敗後，投奔瓦崗寨。翟讓在李密的建議下攻下洛口倉，開倉放糧並打敗前來鎮壓的虎賁郎將劉長恭步兵騎兵二萬五千人。翟讓推舉李密當首領，稱魏公。山東長白山賊首孟讓，河南鞏縣長史柴孝和、侍御史鄭頤，虎賁郎將裴仁基及其子裴行儼，武陽郡丞元寶藏，黎陽義軍寇首領李文相，洹水義軍首領張升，清河義軍首領趙君德，平原義軍首領郝孝德等人或率部或獻城或獻關投靠李密，瓦崗軍聲勢更加壯大。

③宇文化及在江都弒殺隋煬帝自立，洛陽留守越王楊侗登基即位，派人冊封李密為太尉、尚書令、東南道大行臺行軍元帥、魏國公。正當李密和宇文化及雙方拼的精疲力盡時，王世充趁機排除滅異己，獨攬洛陽隋廷朝政。後來，李密被王世充大敗於邙山腳下，裴仁基、祖君彥、程知節等被擒，邴元真、單雄信等人相繼投降王世充，李密西逃長安，投奔李淵。隨後，瓦崗軍戰將秦叔寶、徐世勣、羅士信、程咬金等也都先後降唐。

瓦崗眾人根據當時情形，投奔李世民是唯一長遠出路。農民起義軍自己建立政權得不到門閥士族集團的支援，難以建立固定後方，從李密與王世充爭霸失敗就能說明問題。當初失敗後的瓦崗將領面臨兩種選擇，投奔王世充或者李世民。邴元真、單雄信等人就投奔了王世充，秦叔寶、徐世勣、羅士信、程咬金等人對王世充不看好，加之李密投奔李淵，他們投奔李世民也是順理成章的事情。