反艦導彈能夠被近防武器攔截，代表距離艦艇有一定距離，傷害不會太大，對艦艇沒什麼傷害，但是對甲板上的人是有傷害的，所以近防武器啟動時甲板不能有人，全艦一級戰鬥部署，只要被攔截傷害忽略不計。

結果很難說，因為要綜合考慮幾個問題，大致可歸納到兩項：1）來襲導彈的型別 2）攔截所使用的武器種類。

來襲導彈的種類，實際上包含幾個影響因素。首先是導彈的尺寸和速度，如果是SS-N-19這樣的巨無霸導彈，即便只剩下半枚導彈，數噸的殘片以超音速砸到艦體表面，也會產生相當大的破壞，何況SS-N-19的常規戰鬥部殺傷範圍大約是1~1.2千米。如果戰鬥部落入水中爆炸，可能會產生相當有趣的效果（蘇聯曾進行過一些試驗，但這種效果就像二戰日本人追求的艦炮水中彈效果一樣，屬於可遇而不可求）

而且，導彈型別也會決定戰鬥部的尺寸和殺傷原理。比如東亞萌兔的C-802，採用自鍛破片式的殺傷原理，即便被提前引爆也會把目標打成“麻子”，當然因為戰鬥部裝藥有限，所以目標應該不會受到太嚴重的損失。

還有一點，就是剩餘燃料產生的火災。當然，如果導彈在穿入艦體前被擊毀，這種火災幾乎不會發生。但考慮到早年英國曾一度懷疑擊中“謝菲爾德”號的飛魚導彈根本沒有爆炸，而是單純依靠火災讓英華人焦頭爛額（不過最近的報告透過進一步的模擬，還是確定戰鬥部成功引爆）燃燒的效果還是相當大的。

至於為什麼要考慮攔截武器，主要是因為現代反艦導彈的防禦水平已經有所提高，傳統的小口徑高射速不一定能夠將導彈機會，很可能只是將其打殘，如果碰上超音速反艦導彈，那麼即便攔截成功，導彈可能也會擊中艦船。