刻蝕3nm鐳射在氬原子惰關態下以每微秒20~30脈衝光子衝擊，臨界遷躍杜特耳特性符合即滿足以定態擾動條件納什比係數擴張值，相關遷界位元值不足以導致分子玻爾函式閾的極值化，此種分子可以認定為非編碼。

對於新發現RNA，如果該RNA具有編碼功能，那就具有較大的可能性在現在已知的蛋白資料庫中比對上相似的蛋白序列。其二，檢視時候具有完整的開放性閱讀框（Open Reading Frame, ORF），包含起始密碼子和終止密碼子。

非編碼RNA是指可以從DNA轉錄成RNA，但不繼續翻譯成蛋白質的RNA。非編碼RNA序列包括核糖體RNA、轉運RNA、microRNA、長非編碼RNA (long noncoding RNA)、細胞外RNA (exRNA) 等多種型別[1]。

那麼如何確定一種RNA分子是非編碼RNA呢？

(1)如果已知這種RNA分子的基因ID（Gene id）或轉錄本ID（Transcript id），可以直接在基因組註釋檔案中查詢對於它的註釋，從而判斷它是否屬於非編碼RNA。

基因組註釋(Genome annotation) 是利用生物資訊學方法和工具，對基因組所有基因的生物學功能進行高通量註釋 [2]。基因組註釋檔案可以從GENCODE(https://www.gencodegenes.org/)，ENSEMBL(https://useast.ensembl.org/index.html)等可以檢索基因組學資訊的基因組學專案的網站下載。在上述網站下載的“.gtf”或“.gff”格式的註釋檔案中，如果想查詢的RNA分子的基因ID所對應的註釋檔案標註為“rRNA, tRNA, miRNA, snRNA, snoRNA, misc_RNA, mitochondria tRNA and rRNA, lincRNA”等資訊，則為非編碼RNA。

(2)如果不知道這種RNA分子的基因ID或轉錄本ID，但已知它的序列資訊，那麼可以透過Blast等比對方法，將這段RNA序列與已知基因組的序列進行比對，找到這段序列位於基因組的位置：

如果比對結果落在基因組已註釋的位置，則可以直接獲得這段序列的基因ID和基因組檔案的註釋資訊，步驟同(1)。

如果比對結果落在未註釋的位置，則可以透過計算生物學軟體，計算這段序列的翻譯能力的大小，如果翻譯能力小，則代表該RNA分子幾乎不可能翻譯成蛋白質，符合非編碼RNA的定義。可以計算一段序列的非編碼能力的軟體有COME(http://lulab.life.tsinghua.edu.cn/RNAfinder/CP.html)，CPC(http://cpc.cbi.pku.edu.cn/)等。

(3)如果不知道這種RNA分子的序列資訊，則可以透過實驗的方法，擴增並測序，獲得它的序列資訊，之後與(2)步驟相同。

參考文獻

[1] Mattick, J.S. and I.V. Makunin, Non-coding RNA. Hum Mol Genet, 2006. 15 Spec No 1: p. R17-29.

一般非編碼RNA的確定要經過生物資訊分析和實驗驗證。對於已知的非編碼小RNA如miRNA，tRNA，snRNA等，可經過同源比對，與已知物種的非編碼小RNA的相似度來確定。而對於另一些長度小於100nt的非編碼小RNA，要透過生物資訊軟體分析預測來確定，一般根據序列特徵和結構來判定。長度大於200nt的RNA，新分析是否能夠翻譯成為蛋白質即它是否具有較長的開放閱讀框，其次要將此RNA在體外轉錄翻譯，檢測其是否能形成蛋白來確定。

首先需要經過生物資訊分析，比如進行序列比對和翻譯，確認這條序列沒有比較長的完整編碼區，然後需要將這段序列克隆到真核表達載體中進行真核細胞內表達翻譯，此載體帶有標籤蛋白，以便後續的western檢測。也可以採用真核無細胞表達系統進行表達翻譯實驗，同時設定陽性對照。例如確定能成功表達出蛋白的GFP序列，以相同的條件克隆到表達載體並進行體外表達實驗。最後經過抗體檢測標籤蛋白序列，看目的序列是否能表達出蛋白條帶，如果沒有條帶被雜出來而陽性對照有條帶，才可以確定這條序列是長鏈非編碼RNA。