中國企業孵化器經歷了二十幾年的發展，已經進入穩定發展期。每年都有新增企業孵化器。截止2010年底，中國企業孵化器已由2000年的164家發展到894家，成為僅次於美國的孵化器大國。 儘管中國科技企業孵化器發展迅速，但仍然存在著區域間發展不平衡，孵化功能不完善，融資平臺欠缺和人員素質偏低等多方面的問題。中國的科技企業孵化器在不同地區之間、不同省份之間以及不同城市之間的數量差異較大。中國的大部分科技企業孵化器過於集中在東部地區及少數中心城市，沒有形成面向全國的輻射效應，極大地制約了中國孵化器事業整體上的協調發展。 其次，中國現有的企業孵化器基本上是由政府直接或間接提供大量的資金專門興建的，硬體設施完備，收費低廉，為在孵企業提供了良好的基本服務支援。但是，除極少數企業孵化器對企業的具體運作提供全面支援外，絕大部分企業孵化器都無能力提供全方位的管理服務，孵化器的功能尚需增強。 此外，在債權性融資等方面，由於中小企業普遍無法提供可以質押和擔保的有形資產，信用體系尚未建立健全，而銀行風險規避的需要等因素，導致了中國中小企業基本上很難從銀行等金融機構獲得債權性融資。 而中國現有企業孵化器的許多管理人員來自於政府機關或事業單位，服務意識不夠，普遍缺乏經營管理能力，缺少創業經驗，也缺乏高水平的技術能力和技術依託。這就直接影響了科技企業孵化器的運作效率，影響孵化器的服務質量和水平。