《水滸傳》原著與新版電視劇的主要差別在於梁山好漢全夥受招安以後。《水滸傳》一百二十回本中第八十二回梁山受招安，後面還有三分之一講述徵遼國，徵田虎、王慶，擒方臘。可以說這些內容主要都是大規模征戰場面，以及最後梁山好漢戰死沙場馬革裹屍的輝煌與悲壯！然而在新版電視劇中這一部分卻被草草帶過，匆匆了事。這是兩者之間的最大區別，或許大的戰爭場面費時費力又費錢吧，但說實話總是有點虎頭蛇尾的感覺。

另外就是電視劇內容做了一些改動和刪減，雖然電視劇不可能完全按照原著來拍，但改動的地方有些不妥，比如人物的造型、刻畫就與原著有較大出入，尤其是秦明，梁山馬軍五虎將之一，在電視劇中卻成了醬油，以至於讓那些沒看過原著的人誤認為秦明太水，在與林沖雙戰關勝時整個一個拖後腿的主。但在原著中秦明除了栽在史文恭手裡以外沒有敗績（祝家莊與欒廷玉對戰並沒有敗）。

總而言之，電視劇應該最大程度的還原原著，而不是肆意去改編原著，誰也不可能改編的讓所有人都認可，因為每個人心裡都有一本屬於自己的《水滸》。

個人覺得最新版水滸和原著的主要差異在於征討方臘時將領的死法。

比如原著中矮腳虎王英和一丈青扈三娘都是被方臘手下包道乙的徒弟鄭彪，鄭魔君殺死的。而在電視劇中兩人都是被小兵砍死的。浪裡白條張順在原著裡死的時候是晚上到了電視劇裡面變成了白天。