現在的電子顯微鏡是將精銳的光學顯微鏡技術、先進的光電轉換技術、液晶螢幕技術完美地結合在一起而開發研製成功的一項高科技產品。從而，我們可以對微觀領域的研究從傳統的普通的雙眼觀察到透過顯示器上再現，從而提高了工作效率，減少疲勞。

數碼顯微鏡與普通顯微鏡之間的不同，有下面的五大區別：

1．具有顯微攝像功能，把觀察到的顯微效果儲存下來，形成圖文檔案，可給相關部門互相傳閱；普通顯微鏡只能透過目鏡觀察，不能進行顯微攝像。

2．與電腦相接，可以實現多人同時觀察；普通顯微鏡只能一人觀察。

3．透過電腦螢幕預覽，可以減少眼睛疲勞；普通顯微鏡則需要每時每刻透過目鏡觀察，容易造成眼睛過度疲勞。

4．數碼顯微鏡的成像裝置可以有測量，列印圖文報告，錄影等功能；普通顯微鏡只能單純的進行顯微觀察。

5．數碼顯微鏡是現代科學儀器儀表發展的一個新時代，具有很多普通顯微鏡沒有的功能。它在科學研究、產品檢測、教學演示、考古等方面都有迅速的發展。

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