發酵飼料中含有大量的有益微生物，例如乳酸菌、芽孢桿菌、酵母菌、擬桿菌和麴黴菌等。就目前而言，發酵飼料的常用菌種是乳酸菌、酵母菌和芽孢桿菌。這些微生物在動物體內能夠透過自身及其代謝產物對致病菌產生非特異性的頡頏作用，能抑制或減少有害菌的生成，從而能調節畜禽腸道生態平衡。
發酵飼料有哪些優點呢？
1、可抑制飼料中有毒有害物質，如豆粕中含有的大豆抗原蛋白、胰蛋白抑制因子、植物凝集素、脲酶等抗營養因子，透過微生物發酵能改善其營養物質的消化吸收，減少腹瀉的發生，提高動物健康。用枯草芽孢桿菌和米麴黴菌發酵後的豆粕，豆粕中大分子物質從40%降低到2%和8%，胰蛋白酶抑制因子分別減少了96%和82%，僅用枯草芽孢桿菌發酵大豆粕，也得出了類似的結論，發酵豆粕中的胰蛋白酶抑制因子顯著下降，大豆的營養價值也有所提高。此外，透過微生物發酵後，能降低或是消除棉籽粕中含有的棉酚、環丙烯脂肪酸、植酸及植酸鹽、非澱粉多糖等抗營養因子，增加採食量、維護動物健康、降低飼料中的有害物質、提高動物機體免疫力。
2、發酵還可以利用一些雜糧、雜粕和農副產品的下腳料等非常規飼料進行發酵，這不僅能降低飼料的成本，還可以增加產品的收益。用酵母菌發酵的木薯片蛋白濃縮飼料代替豆粕，提高了瘤胃發酵效率、腸道微生物蛋白合成率和營養物質消化率，並降低飼料成本。
3、厭氧發酵飼料，可以使飼料中的纖維物質軟化，且芽孢桿菌、酵母菌等好氧微生物的存在為乳酸的厭氧發酵提供了良好的條件，使乳酸菌產生大量的乳酸，降低飼料的pH，使得發酵飼料產生特有的酸香味，改善適口性，提高動物採食量。利用乳酸菌對飼料進行發酵時，在發酵期間可以產生酸性物質可殺滅和抑制雜菌的生長，產生濃郁的酸香味，對於改善動物產品風味和飼料的適口性具有良好的效果。
發酵飼料有哪些缺點呢？
1、僅適合自配料客戶使用，若是直接飼餵全價顆粒料，沒辦法使用發酵飼料。
2、最好是現用現配，避免二次發酵引起全價料過酸。
發酵飼料中含有大量的有益微生物，例如乳酸菌、芽孢桿菌、酵母菌、擬桿菌和麴黴菌等。就目前而言，發酵飼料的常用菌種是乳酸菌、酵母菌和芽孢桿菌。這些微生物在動物體內能夠透過自身及其代謝產物對致病菌產生非特異性的頡頏作用，能抑制或減少有害菌的生成，從而能調節畜禽腸道生態平衡。
發酵飼料有哪些優點呢？
1、可抑制飼料中有毒有害物質，如豆粕中含有的大豆抗原蛋白、胰蛋白抑制因子、植物凝集素、脲酶等抗營養因子，透過微生物發酵能改善其營養物質的消化吸收，減少腹瀉的發生，提高動物健康。用枯草芽孢桿菌和米麴黴菌發酵後的豆粕，豆粕中大分子物質從40%降低到2%和8%，胰蛋白酶抑制因子分別減少了96%和82%，僅用枯草芽孢桿菌發酵大豆粕，也得出了類似的結論，發酵豆粕中的胰蛋白酶抑制因子顯著下降，大豆的營養價值也有所提高。此外，透過微生物發酵後，能降低或是消除棉籽粕中含有的棉酚、環丙烯脂肪酸、植酸及植酸鹽、非澱粉多糖等抗營養因子，增加採食量、維護動物健康、降低飼料中的有害物質、提高動物機體免疫力。
2、發酵還可以利用一些雜糧、雜粕和農副產品的下腳料等非常規飼料進行發酵，這不僅能降低飼料的成本，還可以增加產品的收益。用酵母菌發酵的木薯片蛋白濃縮飼料代替豆粕，提高了瘤胃發酵效率、腸道微生物蛋白合成率和營養物質消化率，並降低飼料成本。
3、厭氧發酵飼料，可以使飼料中的纖維物質軟化，且芽孢桿菌、酵母菌等好氧微生物的存在為乳酸的厭氧發酵提供了良好的條件，使乳酸菌產生大量的乳酸，降低飼料的pH，使得發酵飼料產生特有的酸香味，改善適口性，提高動物採食量。利用乳酸菌對飼料進行發酵時，在發酵期間可以產生酸性物質可殺滅和抑制雜菌的生長，產生濃郁的酸香味，對於改善動物產品風味和飼料的適口性具有良好的效果。
發酵飼料有哪些缺點呢？
1、僅適合自配料客戶使用，若是直接飼餵全價顆粒料，沒辦法使用發酵飼料。
2、最好是現用現配，避免二次發酵引起全價料過酸。