首先孔雀魚不像我們所知道的小丑魚、黃鱔、石斑魚一樣屬於性別可逆轉的魚類，所以性別一旦確定後性別不會發生逆轉，一些魚友講的自己養的魚一段時間後由雌魚變成雄魚或者由雄魚變成雌魚了，這種情況一般是自己在幼魚時沒有對性別判斷好，剛開始孔雀魚的雌雄可能沒那麼好區分，孔雀魚三個月左右就達到性成熟。

這時候的性別特徵才是很好判斷的，有的會在小魚一個月左右時對小魚的性別進行判斷，常用的判斷方法比如，雄魚早髮色，還有雌魚腹部逐漸膨大，靠近生殖孔的部位會出現黑色胎斑，臀鰭呈現扇形，雄魚的肚子瘦弱，臀鰭呈現棒狀，其實比較小的魚臀鰭判斷的方法很難辨別的。雌雄魚的性別時形成了不能改變的，但是一些指標還是可以影響雌性雄性的性別比例，比如溫度，通常來講，養殖最好溫度控制在22-26比較適合，但養殖溫度較低時，後代中會出現比較多的雌性，大概與種群需要更多的雌性魚類來繁殖後代來應對這個不適合的環境溫度。

另一個就是水質的酸鹼性，孔雀魚適合的水質是中性的，但當養殖水質比較酸時，後代中會出現比較多的雌性，大概與種群需要更多的雌性魚類來繁殖後代來應對這個不適合的環境條件，原理和溫度是一樣的，自然狀態下，一批後代中，往往雌性相對於雄性比較少，防止過量繁殖導致食物以及空間不夠。