物流企業代收貨款後跑路，如果金額不大，屬於經濟糾紛，與物流企業，協商，要求主動歸還。如果協商後，仍然拒絕歸還，可以到法院起訴，要求歸還。

如果代收貨款金額巨大，可以向公安機關辦案，由國家公權力介入，查詢蹤跡，要求限期歸還。如果仍不歸還，可以向法院提起刑事自訴，請求法院追究物流企業的刑事責任；同時向法院提起刑事附帶民事訴訟，要求返還侵佔代收的貨款。

辦法倒是有。1、預防。選擇信用好的物流企業來合作。一方面，該企業大、資金雄厚，規章制度完善;二方面，很少有違約，信譽佳。三方面，如果你較強勢的話，與物流籤合作合同時，可向其收取保證金或押金。另外，可叫物流買保險或自己買保險。如果你強勢的話，可以物流買保險作為合作條件。物流想做大的話，都要設法取信客戶，拿出部分利潤買保險是取信客戶的最佳辦法。與這樣的物流公司合作是商家的首選。最後，代收款數額不宜太大，這是防止物流起壞心的又一辦法。2、追討。物流企業捲款走人，應及時報案。爭取第一時間控制有關人員並控制贓款物的流失。