儘管是身體排洩系統的自然產物，但健康人體產生的尿液是無菌的。首次汙染可以發生在排尿過程中，因為有可能沾染尿道上皮細胞內的細菌。在離開身體後，無菌尿液還可以被空氣或容器中的細菌沾汙。實際上，由於自然產生的無菌環境幾乎不存在，一旦尿液離開身體，馬上就會失去無菌性。

在探討尿液無菌時，通常是指不包含細菌，其它微生物或孢子。這是一種尿液被排出體外之前儲存在膀胱時的狀況。有時容易被忽視的事實是，尿液等無菌物質對生命有一定支援作用。實際上，儘管尿液包含的尿素在農業應用方面很有吸引力，但它必須經過稀釋才可以安全使用。

尿液的主要成分是水，大約佔總液體量的95%。剩下的5%主要由尿素，以及身體產生的有機物組成（幫助身體清除多餘氮）。氯化物，鈉，鉀等有機和無機化合物，以及其它溶解離子在尿液中的數量通常都非常少。

在有疾病或使用藥物的情況下，有可能造成尿液成分受到干擾。例如，糖尿病人的尿可能包含一定數量葡萄糖。此外，特定食物或藥物也可以給尿液造成短期影響（特別是顏色）。即使是這種情況下，尿液也是無菌的。而造成尿液帶菌的主要原因是尿道感染，因為微生物會玷汙膀胱中的尿液。

討論尿液是否無菌主要涉及它是不是適合飲用。在無菌的情況下，喝尿是能保證安全的，特別是數量不多的情況下更是毫無問題。由於尿主要是由水和身體產生的廢物組成，因此還有少量營養價值。在緊急情況下，喝尿還是一種可以接受的水合方式。但應知道，重複飲尿會給腎臟這一過濾器官帶來壓力。。