38號公告第三條規定，增值稅一般納稅人取得的增值稅專用發票列入異常憑證範圍的，大體可以分為三種情況進行處理。

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情況一

異常憑證計入進項稅額的納稅人，尚未抵扣的異常憑證暫緩抵扣，已抵扣的進項稅額應作轉出處理；

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情況二

異常憑證用於出口退稅的納稅人，尚未退稅的異常憑證暫緩辦理出口退稅，已經退稅的應補繳退稅；

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情況三

異常憑證用於消費稅抵扣的納稅人，參照增值稅處理方式，即尚未抵扣的異常憑證暫緩抵扣，已抵扣的應抵減可抵扣消費稅額或補繳消費稅。

　　同時，38號公告為取得異常憑證的納稅人提供了稅收救濟手段。納稅人對異常憑證認定存在異議的，可以向主管稅務機關提出核實申請，經核實符合相關規定的，可以繼續申報抵扣、申請出口退稅或申報抵扣消費稅。

　　特別需要注意的是，對於取得異常憑證且已經申報抵扣增值稅、辦理出口退稅或抵扣消費稅的納稅信用A級納稅人，可自接到稅務機關通知之日起10個工作日內，及時提出核實申請，如確實符合相關規定，可不作進項稅額轉出、追回已退稅款、抵扣消費稅等，這充分體現了納稅信用的價值。

關於這個問題回答如下：

1.首先要分析異常憑證是如何取得的，如果是非法取得的，則增值稅專用發票增值稅進項稅額不得抵扣，企業所得稅不得作為稅前扣除憑證。

2.如果異常憑證是合法取得的，對納稅信用等級是A級的納稅人來說，應該在10天內申請稅務機關核實，經稅務機關核實可以不用進行增值稅進項稅額轉出處理，涉及出口退稅的，可以依法辦理出口退稅。如果不在規定時間提出核實申請，按非法取得異常扣除憑證處理。非A級納稅人如果是如果是合法取得的，也可以向稅務機關提出核實申請。一般要求先做增值稅進項轉出處理或不予出口退稅，但經稅務機關核實屬於合法取得後，可以重新抵扣或依法辦理出口退稅等。

3.如果稅務機關通知你公司說相關發票為異常憑證，應認真進行自查，看相關發票是否為合法取得，透過檢視商品出入庫記錄、轉賬記錄、物流記錄、採購申請審批記錄等證據，及時向稅務機關進行申辯，避免被稅務機關誤傷給企業帶來不必要的損失。