目前還是以預防為主，主要就是:

1、條件允許，在地塊充足情況下，儘量選擇輪作，不可連作。

2、連作情況下，適時進行合理有效的土壤改良以殺死土壤中的病原菌。（乾界生物還原菌+米糠處理，恢復菌落平衡，殺死土壤病蟲源，調理土壤理化性質，補充土壤有機質）

3、化解作物根部化感作用和自毒作用產生的自毒物質，根本上解決連作障礙。（乾界生物長豐菌灌溉）

4、選擇健康無病苗，做好壯苗、健苗措施，增強整體長勢，增強抗逆性、降低染病機率。（如自己做育苗，可使用神苗菌新增入育苗基質中）

只有做好這幾方面苗期工作來防治辣椒立枯病。1主要應該對土壤進行消毒殺菌。用福爾馬林50克加水10千克，澆灌基質1平方米，同時還必須加殺菌劑，百菌清500倍液，然後用草苫覆蓋7一10天。2當幼苗出土20左右，要嚴格控制澆水，澆水量不能過大過多。過大過多，造成立枯病。如何這時發生立枯病，必須進行藥劑防治。地面幼苗可以用50%代森銨200倍液進行防治，還可以用0、5%硫酸亞鐵、1%波爾多液200。地下土壤可用殺菌劑百菌清1000倍液進行一灌根一至二次，間隔6一7天一次即可。以消滅土地下地面病菌，保護幼苗。3發現個別幼苗發病，要立即拔掉，並噴藥防治，以防止病菌蔓延傳染。

該病除為害辣椒外，還為害番茄、茄子、黃瓜、萵苣等。一般幼苗出土後病害就可以為害，以中後期發病最為嚴重，幼苗受害後莖基部產生褐色橢圓形病斑，發病初期幼苗白天葉片萎蔫，晚間恢復正常，數天後不能恢復原狀，但病苗上產生白色絮狀黴層。

防治方法：

1.種子處理。用50%多菌靈可溼性粉劑進行拌種，用量為種子量的0.4%；

2.用98%惡黴靈1:800倍液對床土進行消毒；

3.發現中心病株立即拔除，並用98%惡黴靈噴霧，每7-10天一次，連續3-4次。