因為“可燃冰”中存在兩種溫室氣體甲烷和二氧化碳。甲烷是絕大多數“可燃冰”中的主要成分，同時也是一種反應快速、影響明顯的溫室氣體。“可燃冰”中甲烷的總量大致是大氣中甲烷數量的3000倍。作為短期溫室氣體，甲烷比二氧化碳所產生的溫室效應要大得多.

有學者認為，在導致全球氣候變暖方面，甲烷所起的作用比二氧化碳要大10-20倍。如果在開採中甲烷氣體大量洩漏於大氣中，造成的溫室效應將比二氧化碳更加嚴重。而“可燃冰”礦藏哪怕受到最小的破壞，甚至是自然的破壞，都足以導致甲烷氣的大量散失。而這種氣體進入大氣，無疑會增加溫室效應，進而使地球升溫更快。

很多科學家認為，天然氣水合物中的甲烷最終將對全球氣候產生穩定的影響。在冰期開始時，地球變冷，冰蓋擴大而引起海平面下降，海平面的下降又引起對海底壓力的下降，這樣就引起了天然氣水合物的離散和甲烷釋放，增加大氣的溫室效應，從而阻止了全球繼續變冷。這樣，天然氣水合物可能是穩定全球溫度的一個重要因子。

由此看來，可燃冰對環境的影響十分巨大。