水質檢測有106項指標，且多數需要標準品。因此自制標準品或自己檢測是很麻煩的。106項水質指標中，42項為常規水質監測指標，64項為非常規水質監測指標。

根據國家衛生計生委要求，自來水常規水質監測指標為42項，不包括苯。

水質常規指標

微生物指標（4項）：總大腸菌群、大腸埃希氏菌、耐熱大腸菌群、菌落總數

毒理指標（15項）：砷、硒、四氯化碳、鎘、氰化物、溴酸鹽、鉻、氟化物、甲醛、鉛、硝酸鹽、亞氯酸鹽、汞、三氯甲烷、氯酸鹽

感官性狀和一般化學指標（17項）：色度、鐵、溶解性總固體、渾濁度、錳、總硬度、臭和味、銅、耗氧量、肉眼可見物、鋅、揮發酚類、水溶液酸鹼度、氯化物、陰離子合成洗滌劑、鋁、硫酸鹽

放射性指標（2項）：總ɑ放射性、總β放射性

飲用水消毒劑指標（4項）：氯氣及遊離氯製劑、臭氧、一氯胺、二氧化氯

據介紹，《生活飲用水衛生標準》（GB5749-2006）106項水質指標中，42項為常規水質監測指標，64項為非常規水質監測指標。

常規指標是反映生活飲用水水質基本狀況的指標，檢出率高，為各地水質監測的必檢專案，包括4個微生物指標、15個毒理學指標、17個感官性狀和一般化學指標、4個消毒劑指標和2個放射性指標。非常規指標是根據地區、時間或特殊情況需要實施的生活飲用水水質指標，包括2個微生物指標、59個毒理學指標和3個感官性狀和一般化學指標。各地根據本地區的水質情況，將超標風險大的非常規指標納入常規水質監測專案，並確定監測頻次。