常見的芸豆的病蟲害有見瓜類白絹病、菜豆菌核病、菜豆細菌性疫病等幾種，當芸豆出現莖基部呈暗褐色，表面密生白色絲狀菌絲束，那麼一般是患了見瓜類白絹病。這些病害是非常嚴重的，會導致芸豆落花、爛菜等。

防治芸豆病害

　　一、要注意施肥，或者溝施菌肥，這樣可以有效的抑制土傳病害，而且還能夠促進生新根能力，合理使用菌肥是最為理想的防治方法。利用以菌抑菌的道理預防根部病害，這樣可以起到事半功倍的效果，而且在菌繁殖的過程中，還會產生的代謝產物，這些產物可以促進根系生長。

　　二、要控制棚室溫度，這樣可以確保芸豆正常坐莢。要保持較高的溫度，這樣可以促進莖蔓的發育;在芸豆開花的期間，白天要把溫度控制在20-24℃作用，不能超過24℃，這樣可以防止溫度過高而引起芸豆落花;而在結莢期，可以適當的提高溫度，這樣有利於果實和莖蔓的發育。

　　三、除了以上的兩種防止方法之外，還可以選用無病種子播種、與非豆科作物輪作二年、噴布0.5%波爾多液殺蟲等方法，這些方法都是比較有效的。