馬士英這個人比較矛盾，首先來說以馬士英為首的閹黨和東林黨人的黨爭惡鬥產生了很大的惡果。比如說，當時清兵剛入關，暫未在北方站穩腳跟。此時正是北伐收復失地的絕佳機會，但是因為馬士英搞黨爭，與東林黨人惡鬥，排擠有中興思想的史可法，使得北伐計劃泡湯。其人幾乎沒有國家意識，只知道剷除異己，不惜做出親者痛，仇者快的事情來。即使在清兵壓境的情況下，仍然要和左良玉等異己決鬥。因此，當時，清兵輕而易舉地攻下揚州和南京，弘光朝廷滅亡。但是，和他的好朋友，同為閹黨核心阮大鋮相比卻顯得相當有民族氣節。

當時，弘光被俘，魯王朱以海在浙東監國。馬士英原本想投奔魯王，但是呢，因為名聲實在太臭，連魯王都不要他。當時的馬士英完全可以和他的朋友阮大鋮一樣在南京城破的時候投降清朝，享受榮華富貴。但是，馬士英的人物矛盾點就在這裡。馬士英從來就沒想過投降清廷，即使自己被明皇室給排擠掉，自己處於孤立無援的情況下。成了無家可歸的孩子，馬士英自己在太湖流域組了一支抗清武裝，與魯王的軍隊形成策應。不過，堅持了不久就被清軍給個個擊破，馬士英不幸被俘。被俘虜後的馬士英也是拒絕投降，只求一死，這與阮大鋮形成了鮮明對比。最後，馬士英英勇就義。

所以，有時候一些歷史人物很矛盾，在你恨他咬牙切齒的時候，又有某些方面讓我們肅然起敬。所以，功過難說，壞人不一定都是方方面面都壞。明朝歷史上就有這麼一些人物，比如周延儒，還有李成棟這個人，這比馬士英還要矛盾。