一、儲存環境

蜂蜜醃檸檬的儲存時間因環境不同而不同，例如密封后放在冰箱中最長可儲存3個月，而在常溫下則只能儲存1～2周左右，最短時儲存3～4天便可能發生變質，因此要延長蜂蜜醃檸檬的保質期最好放在冰箱的冷藏室中儲存。

二、儲存容器

蜂蜜醃檸檬的儲存時間因容器不同而不同，但注意這裡說的主要是容器的密封效能，一般而言容器的密封效能越好則保質期越長，反之則蜂蜜醃檸檬的保質期相對也越短，因此蜂蜜醃檸檬最好選用能完全密封的容器儲存。

三、確保乾燥

蜂蜜醃檸檬儲存時最大的“敵人”是水分，簡單來說混入的水分越多則保質期相對也越短，因此在製作時一定要將檸檬擦乾後再切片，裝入容器中醃製時要確保容器中沒有水分，另外在取用時也要用乾淨且乾燥的筷子夾。

四、合理取用

蜂蜜醃檸檬提前變質多因取用不當導致的，比如將容器開啟後長時間暴露在空氣中，又比如用帶水的筷子或勺子取用，實際上這些都會影響蜂蜜醃檸檬的保質期，因此取用時要“速戰速決”並確保筷子或勺子上沒有水分。