宋代，扁鵲被奉為“醫者之師”。《宋史》記載宋仁宗為扁鵲建廟，並尊扁鵲為醫神，封號“靈應侯”，後又封為“神應王”。道教尊其為“靈應妙醫藥王真君”等。

《史記·扁鵲列傳》載扁鵲事凡四：曰受醫長桑君，曰診疾趙簡子，曰救治虢太子，曰望診齊桓侯。

受醫長桑君一事，除《史記》外，諸書俱無載、無考。扁鵲青年時曾替貴族管理客館，因而結識了奇人長桑君，與其結交，習得肉眼透視人體的能力，能“視見垣一方人”，成了被人認為是起死回生的神醫，其後開始往各國行醫。

診疾趙簡子事，《史記·趙世家》、《史記·扁鵲列傳》、《論衡·紀妖》皆載。《扁鵲列傳》記此事為晉昭公時，《索隱》曰：“案《左氏》，簡子專國，在定頃二公之時，非當昭公之世。且《趙系家》敘此事亦在定公之初。”《史記•趙世家》載：“晉頃公之十二年，六卿以法誅公族祁氏、羊舌氏，分其邑為十縣，六卿各令其族為之大夫。晉公室由此益弱。後十三年，魯賊臣陽虎來奔，趙簡子受賂，厚遇之。趙簡子疾，五日不知人。……晉出公十七年，簡子卒。”趙簡子執政於晉頃公、晉定公二公之際，即前525——前475年，卒於公元前458年。《史記正義》於《扁鵲列傳》、《趙世家》“七世而亡”句下注曰：“晉定公、出公、哀公、幽公、烈公、孝公、靜公為七世。靜公二年，為三晉所滅。據此及《趙世家》，簡子疾在定公十一年也。”晉定公十一年即前501年，秦越人診疾趙簡子。《史記·扁鵲列傳》記為“晉昭公”誤。《漢書·高帝紀》顏師古注引韋昭語謂“越人魏桓侯時醫”，《漢書》顏注“魏無桓侯”辨其非。

救治虢太子事，《史記·扁鵲列傳》、《韓詩外傳》卷十、《說苑·辨物》俱載。在虢國（國都上陽，今河南省三門峽市陝州區）行醫，正巧遇上虢國國君的太子猝死。秦越人立刻前往並提供解決之法，他認為太子只不過是患了熱氣病，只要看看下身是否溫暖，聽聽他的耳朵是否有聲響，看看他的鼻孔是否有擴張，就可以知道太子是否仍然生存。他救了虢國太子，自此他起死回生的醫術就不脛而走。唐《史記正義》、劉宋《史記集解》、唐《史記索隱》均認為《史記·扁鵲列傳》所載“（診疾趙簡子事）其後扁鵲過虢”句，古虢國（西虢國）是在此前120年被晉獻公所滅。又洛州汜水縣古東虢國是在此前237年被鄭國所滅。此救治虢太子之扁鵲與號稱扁鵲之秦越人應非同一人。

望診齊桓侯事，《史記》本傳、《韓非子·喻老》、《新序雜事》（卷二）均載。後來到了田齊，遇上了田齊桓公田午，《韓非子·喻老》稱其為蔡桓公（前714——前695年在位），扁鵲一見到桓公，就對他說他有一個小病，只要立刻服藥就可以治好，桓公沒有理會。當扁鵲第二次建議要為他治病時，桓公也置之不理。當第三次扁鵲見到桓公時，桓公發覺自己的身體果然像扁鵲所說一樣，病徵散發出面，極為嚴重，他這才向扁鵲請教，可是扁鵲說由於桓公對於他的勸告置之不理，現在已經沒能救了。過了不久，桓公果然死了。田齊桓公卒年按《史記》與《通鑑》基本一致，即前384——前380年。因此史家對診疾趙簡子事與望診齊桓侯事相差120年多表疑問。

《鶡冠子·世賢》曰：

煖曰：“王獨不聞魏文王之問扁鵲耶？曰：‘子昆弟三人，其孰最善為醫？’扁鵲曰：‘長兄最善，中兄次之，扁鵲最為下。’魏文侯曰：‘可得聞耶？’扁鵲曰：‘長兄於病視神，未有形而除之，故名不出於家。中兄治病，其在毫毛，故名不出於閭。若扁鵲者，鑱血脈，投毒藥，副肌膚間，而名出聞於諸侯。”魏文侯曰：“善。”使管子行醫術以扁鵲之道。

此借扁鵲區別醫術高下喻治國方略之高下，未入《史記•扁鵲列傳》。魏文王，即魏文侯，前445——前396年在位。

《列子》中記載的扁鵲曾進行心臟置換手術。

後來扁鵲到了秦國，替秦武王（前311-前307年在位）醫療後，由於太醫令李醯妒忌扁鵲的醫術，於是設計害死了扁鵲。據傳是在離開秦國的途中，於驪山（今陝西省西安市臨潼區）北面的小路被刺客劫殺。《戰國策•秦策二》卷四《醫扁鵲見秦武王章》：

醫扁鵲見秦武王，武王示之病，扁鵲清除。左右曰：“君之病，在耳之前，目之下，除之未必已也。將使耳不聰，目不明。”君以告扁鵲，扁鵲怒而投其石曰：“君與知者謀之，而與不知者敗之，使此知秦國之政也，則君一舉而亡國矣。”

秦武王之死因舉鼎絕臏，非病在耳之前，目之下。扁鵲之諫，是說秦國選拔才士治國。秦武王二年，初置丞相。以樗裡疾、甘茂為左右丞相。此策當系此年（前309年）。《史記•扁鵲列傳》載扁鵲與趙簡子同時，而秦武王距趙簡子之卒已近150年。

現在醫學上我們稱醫術高超的人為“華佗再世”，“扁鵲重生”，都是用來形容醫生的，可見華佗在醫術上是齊名的，華佗被後人稱為“外科聖手”、“外科鼻祖”。他醫術全面，尤其擅長外科，精於手術。並精通內、婦、兒、針灸各科。

扁鵲由於他的醫術高超，被認為是神醫，所以當時的人們借用了上古神話的黃帝時神醫“扁鵲”的名號來稱呼他。扁鵲少時學醫於長桑君，盡傳其醫術禁方，擅長各科。在趙為婦科，在周為五官科，在秦為兒科，名聞天下。

他天資聰穎，善於總結前代經驗，醫術越來越高超，後來醫術達到了爐火純青的地步，隨之遍遊各地行醫，擅長各科，透過望色、聽聲，即能知病之所在。扁鵲奠定了中醫學的切脈診斷方法，開啟了中醫學的先河。

扁鵲是中醫學的先驅，與華佗起名的存在。而華佗與董奉、張仲景並稱為“建安三神醫”。扁鵲能夠與這些醫學史上留下濃墨重彩，突出貢獻的人物排在一起，可見扁鵲的醫術高超。

可惜這些人中的很多著作因為歷史原因沒有留下來。這是醫學史重大的損失。