雖然無土栽培的蟲害要比土栽輕微許多，但只要種蔬菜就或多或少的會有蟲子來危害，為了保證蔬菜的純淨無汙染，我們可以採用生物防治法。

常見的生物防治法是利用不同植物的屬性差異，比如說驅蟲草她是植物界的另類其貌不揚卻是害蟲的天敵。

還有除蟲菊她的根葉中會產生一種叫除蟲菊脂的物質對昆蟲有殺滅和驅趕的作用。

這些方法驅蟲是不錯，可是一方面它要求我們要非常熟悉每種植物的屬性，這對於非專業的我們確實有些難度，另外如果我們栽培的蔬菜種類單一還好，種類多了，很容易相互影響弱化了驅蟲力量，害蟲又趁虛而入，另一方面這些驅蟲作物又佔了我們蔬菜的空間，雖然很少但是作為強迫症很難忍，本來就很寶貴的養分不但要供給作物還要分享給他們。