液相色譜按分離機理分為吸附、分配、交換、排阻以及親和五種型別。利用組分在吸附劑(固定相)上的吸附能力強弱不同而得以分離的方法，稱為吸附色譜法。固定相是固體，目前這種分離模式在液相色譜中用途很小。利用組分在固定液或者鍵合固定相(固定相)中溶解度不同而達到分離的方法稱為分配色譜法。固定相是塗覆的固定液或者鍵合的固定相，是目前主流的分離模式，涵蓋了目前液相色譜應用範圍的大部。利用組分在離子交換劑(固定相)上的親和力大小不同而達到分離的方法，稱為離子交換色譜法。該分離模式主要用來分離離子型化合物，正是由於如此，現在離子色譜已經從液相色譜中分離出來，稱為離子色譜。利用大小不同的分子在多孔固定相中的選擇滲透而達到分離的方法，稱為凝膠色譜法或尺寸排阻色譜法。這個主要用來分離高分子子化合物，比如蛋白、比如聚合物。利用不同組分與固定相(固定化分子)的高專屬性親和力進行分離的稱為親和色譜法，常用於蛋白質分離。