種子形成後表面看來形態和組織結構都已完善，但內部的物質尚未完善，也可說還沒完全成熟，必須經過一個“後熟階段”（往往在休眠期間進行）才可能發芽。

在種子休眠期間，就算提供種子萌發的所有外界條件，種子也不會發芽，因為外因只是變化的條件，內因才是變化的根據。

其原因得從種子發芽過程和發芽條件說起。

西瓜種子的發芽過程大致可分為吸水、發芽、髮根、出土等幾個階段。西瓜種吸水階段，是從幹種子到吸水膨脹為止。這一階段要求充分的水分和氧氣，種胚（俗稱種仁）吸水後逐步膨脹起來，同時吸入氧氣，排出二氧化碳氣，種子生理活動加強。西瓜種子發芽階段，是從種子膨脹到胚根（俗稱種子芽）發出為止。

脫皮階段，是從側根發出到種皮脫掉。頂鼻階段，是從種皮脫掉到子葉出土。以上三個階段，都要求較高的溫度、較大的溼度和充足的氧氣。

缺少其中任何一個條件，都會影響種子發芽。在生產中往往是因為溫度過低而使種子不能發芽。這是因為，溫度過低影響了種胚的吸水速度的50%，而且種胚不能進行吸水活動，子葉內貯藏的營養物質無法流入胚芽，胚芽得不到必要的營養，自然不會萌發。這就是育苗時西瓜種子不發芽的原因。