耐藥性不是這樣理解的。耐藥是給予一個菌落相對低濃度的某種抗生素環境，因而選擇出了能在這個環境下存活的突變種。這種屬性有一定特異性，並且在長時間脫離該環境後，由於期間細菌的突變始終在發生，因此原來的相對單一菌落逐漸變得複雜，該屬性將逐漸不佔多數。對於人體來說，每次導致某人（比如說）肺炎的細菌並不是同一種，或者即便是同一種，也不是相同基因型的（同一批次）。但是在人群中，一種耐藥的細菌被培養出來，就有可能在人群中傳播。所以耐藥菌問題其實是一種公共衛生問題。導致耐藥的原因主要是濫用，包括不該用時使用，例如病毒感染（雖然此人吃了抗生素僅僅是沒有用，但是，他的排洩物將給予大環境低劑量的該種抗生素，並因此有利於環境中各種細菌對該種抗生素耐藥屬性的培養——或者說篩選）；該使用時不用足（包括時間、劑量）；養殖業的濫用等等。某些抗生素如果長時間在某一地區不使用（往往是因為副作用較大），有可能恢復在該地區對抗菌譜內細菌的敏感性。