招標（檔案）的作用是確定採購產品的生產廠家。最後做什麼，做多少都以雙方簽訂的合同為法律依據。有時候，特別是專案數額較大時，招標單位（採購方）委託招標公司招標時，為了少交一部分招標擁金，招標單位不把所有的採購明細都列入招標檔案中，這樣標的總額就能降低不少，交付的招標擁金就能下降一些，這種情況時常出現，慣例。

招標檔案中很多東西就應該是合同裡的內容，這部分內容如果不一致那合同是不能籤的(除非有正式的修改招標內容的檔案)。因為招標書是法律上已生效的檔案，不是隨便就可以變更的。投標成功但合同與投標時的一些內容不一致，我認為法律上和事實上都說不通，只能理解為招標是一碼事，合同是另一碼事。

合同協議書中約定的條件跟招標檔案不一致的情況，以合同中約定的條款為準。

按照招投標後經過備案的中標合同來確定各自權利義務。

《招標投標法》

第四十六條　招標人和中標人應當自中標通知書發出之日起三十日內，按照招標檔案和中標人的投標檔案訂立書面合同。招標人和中標人不得再行訂立背離合同實質性內容的其他協議。招標檔案要求中標人提交履約保證金的，中標人應當提交。

第五十九條　招標人與中標人不按照招標檔案和中標人的投標檔案訂立合同的，或者招標人、中標人訂立背離合同實質性內容的協議的，責令改正;可以處中標專案金額千分之五以上千分之十以下的罰款。

《最高院關於審理建設工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋》

第二十一條　當事人就同一建設工程另行訂立的建設工程施工合同與經過備案的中標合同實質性內容不一致的，應當以備案的中標合同作為結算工程價款的根據。

合同必須與標書要求符合，超出標書範圍的可以另籤合同或雙方認可的簽訂補充協議，但這是超出標書內容之外的賬目，可能有關聯但視同兩個事項。

雖然這樣的合同雙方簽字確認，但是一旦出現問題，就很難避免不必要的麻煩，若是順利的話可能不影響合同的執行，若有問題的話甲方應該被追責，承擔主要責任，乙方要是拿不出相關證據一樣追責，這都要根據實際情況才能具體分析結果，還要看啥單位，比如私營企業中就以甲方為準，乙方是被動的。

在現實中，這樣的合同不能單純的說是無效，因為合同只要不違背法律法規要求，就應該被執行。

首先確定招標檔案是什麼。它畢競是甲方一方寫出的規定，那怕它符合法律，當然，它也不敢內容違法，但它絕對代表不了法律。所以，違背了招標檔案，不等同於違法。

而合同，是雙方協商制定的，按合同法的規定，雙方所籤合同，是受法律保護的。所以，一旦合同簽定，雙方必須嚴格執行，任何一方不得更改。所以簽定合同是非常嚴肅的事情，一字一句都不可馬虎大意。招標檔案有多長？又能包含多少東西？一份合同絕不會照搬招標檔案而己。

合同如果有些條款違背了招標檔案的初衷，以合同為準。

合同違背了招標檔案怎麼辦？

不存在合同違背招標檔案這一說法，招投標的程式基本如下：

第一：招標人釋出招標公告，說明招標檔案的領取方式。

第二：投標人根據招標檔案要求編制投標檔案，對招標檔案存在疑慮可向招標人提出，招標人向全部投標人發出澄清檔案。投標人在投標截止日期前提交各項投標檔案。

第三：評標-確定中標候選人-下發中標通知書。中標人是對招標檔案全部內容都做了實質性響應。

第四：合同談判。在此階段，招標人可能會對招標檔案內個別內容進行修改和調整（不能是實質性改變招標檔案內容或減少中標價），投標人可以做出接受或拒絕。接受後就會落實到合同條款裡面或以合同談判會議紀要為附件附在合同裡。

所以，最終簽訂的合同是雙方同意的，不存在合同違背招標檔案這一說法。