新成立的汽車工程學院是常熟理工學院獨立設定的整合式、綜合性二級學院，由常熟市委市政府、常熟汽車行業企業、常熟理工學院共同建設，同時對接常熟職教中心，將透過三年建設，逐步建成支撐常熟汽車產業發展的汽車專業技術應用型高階人才培養培訓基地、汽車工程技術創新基地和現代汽車文化展示普及基地，形成汽車產業人才培養體系，全力支撐本市迅速發展的汽車產業，滿足這一產業對技術應用型人才的需求。 這一學院將設立車輛工程本科專業、汽車服務工程本科專業、複合本科專業、職中升本科、專科升本科的對接專業以及汽車方向工程碩士專業。所有專業均實行“校園學習+企業學習”的培養過程。學院車輛工程、汽車服務工程本科專業將與常熟職教中心相關職中、大專專業對接，構建“3+4”和“5+2”高技能人才與技術應用型人才的一體化培養體系，即在職教中心完成3年中職教育或5年高職教育，選拔一批優秀學生到理工學院完成4年或2年本科階段培養，實現中職、高職人才與本科人才培養銜接。