高錳酸鉀：魚缸消毒殺菌用高錳酸鉀是很常見的。因為在過去很長的一段時間內，它都是主流消毒劑，不過其用量要嚴格控制，不然也會對魚兒的健康造成危害，而且由於它具有腐蝕性，用久了也會破壞魚缸的玻璃膠，導致其漏水。

2、二氧化氯：二氧化氯是目前新興的消毒劑，也正在代替高錳酸鉀成為主流，它的用量比高錳酸鉀要小一些，但效果卻毫不遜色，對於細菌、真菌、病毒等都有不錯的殺滅效果，用的時候要關閉過濾氣泵，一小時後重新開啟。

3、聚維碘酮：聚維碘酮也是一種消毒劑，用它給魚缸消毒後，需要注意清洗，以免藥物殘留，對魚兒的健康不利。它對濃度也有一定的限制，用多了也會產生一定的副作用。

高溫暴曬：魚缸消毒最簡單的方式就是將魚缸放在太陽底下暴曬，這種方式適合小型的魚缸。直接將魚缸放在太陽下，暴曬半天或者一天即可。

消毒劑消毒：若是魚缸比較大，不太容易移動的話，可以用消毒劑消毒。常用的消毒劑有高濃度的鹽水、高錳酸鉀溶液等。將它們倒入魚缸中，等一段時間倒掉，再把魚缸清洗乾淨即可。

如果是空的魚缸，發生過傳染性病的容器可用百萬分之五或百萬分之十濃度的漂白粉溶液消毒。發生過寄生蟲病的容器用4%—8%硫酸銅溶液消毒。放藥後經5—7天，將缸水放掉即可養魚。遠征消毒液2號可用於傳染病和寄生蟲病的消毒。　　孔雀石綠：用百萬分之三十的溶液浸泡魚缸等三十分鐘，可起到消毒和殺滅病原微生物的作用。食 鹽：用千分之一的溶液浸泡魚和魚缸等可起到消毒和殺滅病原微生物的作用。也可以用高錳酸鉀溶液水仔細擦洗淨魚缸，再好好沖洗乾淨以後就可以了。

使用殺菌除氯水給魚缸消毒，自來水中都含有氯氣，如果用沒有除去氯氣的自來水養殖觀賞魚，烏龜等水生寵物。會對他們的全身器官和系統造成極大的傷害。