巴氏消毒法是巴斯德氏消毒法的簡稱，是利用低於100攝氏度的熱力殺滅微生物的消毒方法，由德國微生物學家巴斯德於1863年發明，至今國內外仍廣泛應用於牛奶、人乳及嬰兒合成食物的消毒。

現在用的巴氏消毒法一般有兩種方法：一是把被消毒的物品把加熱到61.1～65.6攝氏度之間，作用30分鐘；二是加熱到71.7攝氏度作用時間至少保持15秒鐘。由於巴氏消毒法所達到的溫度低，故達不到滅菌的程度。但是它可使布氏桿菌、結核桿菌、痢疾桿菌、傷寒桿菌等致病微生物死亡，可以使細菌總數減少90％－95％，故能起到減少疾病傳播，延長物品的使用時間的作用。另外，這種消毒法不會破壞消毒食品的有效成份，且方法簡單。在農村家庭中可用於牛奶、嬰幼兒食用的人乳、合成食物及醬油等調味品的消毒，如果在家庭中被有自動控制的恆溫水浴箱，則使用巴氏消毒法將更為方便、簡單。

巴氏消毒不能徹底的殺死微生物。一些帶有芽孢的細菌、嗜熱菌都可以存活下來。但用高壓蒸汽滅菌法可以比較徹底的滅菌。