新買回的笛子，如果發現竹質不太乾，可將笛子所有孔洞都塞住，然後灌進鹽水（可稍濃一些），浸泡2-4日（根據竹質溼度而定，竹質溼者浸泡時間要長一些），然後開啟各孔將鹽水倒出，再用清水清洗，待一兩個小時後，便可使用。如果買回來的笛子本來竹質很乾而又堅固，最好用酒精擦洗一下笛孔和吹孔的周圍，這樣會使竹內的少許水分隨著酒精的揮發而排除，同時達到消毒的目的。笛子不吹的時候，應放進笛盒內，以防風吹日曬及灰塵進入。另外，可用一塊軟的皮子或堅硬的紙片（約二寸長一寸寬）製成一個“膜擋”蓋在膜孔上，並用細繩將它綁在笛身上，吹奏時將膜擋放到膜的下端，不吹時將它放回蓋住笛膜，以防笛膜受風、變幹、落上灰塵而變質，或因一時不慎將笛膜碰破。每次吹奏完以後，一定要將笛筒內的水甩出來。最好做一個布刷，插入笛筒內擦拭一遍，然後裝入盒內或布套內，這樣就可避免口水在笛筒內發黴、發臭，以致腐爛。笛子是吹奏樂器，應特別注意衛生。笛子最好個人專用，避免傳染疾病。