一般衛生所都配有醫療設施，病人一般的病在衛生所能夠治療好，而衛生室沒有配備醫療設施，頭疼感冒可以在衛生所治療，嚴重一點的病人還需要到衛生所或上一級醫院診治。

衛生所比衛生室規模要大，醫護人員，醫療裝置都比衛生室強。衛生所一般建在鄉鎮，街道辦事處的地方，而衛生室建在村或學校廠礦等也叫醫務室。為保障人民的健康，因此建立有衛生室，衛生所，四三二一級醫院，大病走大醫院，小病就地就珍，既方便了群眾，又節約了國家資源配置。

村衛生室和鎮衛生院是屬於被管理與管理的關係，衛生局透過鄉鎮衛生院管理村衛生室。村衛生室就是一個村級單位的醫療機構，新醫改以後，國家將村級醫療機構統一稱為村衛生室。並將以前的村衛生室、村衛生所、村醫療點進行合併，形成了現在的每個行政村有一所標準化的村衛生室。 村衛生室一律不得租賃、轉讓、承包給他人。村衛生室必須設立在本村轄區內，每個行政村只設立一個定點醫療機構。