按B使用潛水術向上浮就可以了，記得要有碎巖術和怪力術學會

如果想在口袋妖怪漆黑的Wraith中水箭隊搶走潛艇後，找到他們，不過首先要獲得潛水術，去幫大吾打跑火巖隊，他就會給你潛水術，然後就再可以在凱那市潛水下去找到潛水艇和水艦隊，可以按照一下步驟操作。

第一步、從水箭隊成員口中得知火箭隊老大帶著潛水艇跑到了海底洞窟，然後去拿潛水術。

第二步、來到宇宙中心。

第三步、上二樓和大吾並肩作戰。

第四步、然後打敗火巖隊。

第五步、大吾說有個東西要給你。

第六步、然後來到綠嶺市左上角大吾的家。

第七步、大吾就會給你潛水術。

第八步、來到凱那市使用潛水術潛水下去。

第九步、來到水下一個洞穴口。

第十步、進去以後就會看到潛水艇。

十一步、然後打敗水箭隊老大就行了。

在這個水下洞的任意位置（除進門處外）使用潛水術浮起。

然後一直往岸上走進入海底洞窟。

之後到海底洞窟即繼續進行主線水艦隊劇情。

並不是在琉璃島周圍...琉璃島繼續往下走有一大片可潛水的區域，潛水進去有一個山洞叫海底洞穴...不難找的，潛入海底後只有一條路可以走，注意洞口就行。

在送神火山頂部出發玉石劇情後，前往送神火山下的熔岩團治安所，打通後，在卡那茲市船塢觸發水艦隊偷潛水艇劇情後，在水靜市右側衝浪向上可見洞口，進入為水艦隊治安所，全部打通，潛艇逃跑。前往101水道潛水，到達海底洞窟。打通即可。