1、首先需要向自己開店所在地的市級藥品監督管理機構或省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門直接設定的縣級藥品監督管理機構提出開辦申請，領取《藥品經營許可證》。

2、在領完許可證之後，需要去工商局辦理營業執照，稅務登記證，衛生許可證以及健康證。

3、作為一家藥店，經營者還需要施行GSP認證，所謂的GSP就是指藥品經營質量管理，藥店經營一切都需要按照GSP模式運作。

4、如果所經營的藥店內包含保健食品，還需要向藥監申請《保健食品經營許可證》；而如果涉及醫療器械的話，則需要申請《醫療器械經營許可證》。

一般是不需要的 保健品現在很多的

在藥品裡通常合用的扣率實際上就是生活中的折扣，通常是商業公司對醫院，廠商對代理商。比如阿莫西林的單價為20.00元，扣率是85扣，用20.00x0.85=17.00就是實際的單價，說白了就是8.5折

其實你這個問題問得就不是很專業，

首先是你問的手續，我想應該你是想問要些什麼材料是吧？一般來講要看藥店的要求了，以下是一些常見的材料：企業四證（營業執照、稅務登記證、組織機構程式碼、衛生許可證）、產品的檢驗報告、生產單位的生產許可證，如果要求嚴一點的還有很多諸如：保健品批文、商標註冊等等亂七八糟的東西；

另外你問的費用及扣點的問題：這就要看是各個藥店的不同要求了，也要看你的品牌了，如果藥店是很好的連鎖藥店，那自然譬如進場費、新品費、扣點都會很高，約在300－2000不等，如果是一般的小藥店，可能一分錢都不要，另外如果你的保健品很好，或是能品牌很大牌，那相應的費用和扣點肯定會低一些。