簡單的說 溶酶體沒有能分解自身外表的那層膜的酶。

具體的，見下面。

溶酶體的外被是一層單位膜, 內部沒有任何特殊的結構。由於溶酶體中含有各種不同的水解酶類,所以溶酶體在生活細胞中必須是高度穩定的。溶酶體不被分解與其膜的結構組成有關：

?溶酶體膜中嵌有質子運輸泵(H+-ATPase),將H+ 泵入溶酶體內, 使溶酶體中的H+ 濃度比細胞質中高；同時, 在溶酶體膜上有Cl-離子通道蛋白，可向溶酶體中運輸Cl-離子, 兩種運輸蛋白作用的結果，就等於向溶酶體中運輸了HCl, 以此維持溶酶體內部的酸性環境(pH約為4.6～4.8)。

?溶酶體膜含有各種不同酸性的、高度糖基化膜整合蛋白, 這些膜整合蛋白的功能可能是保護溶酶體的膜免遭溶酶體內酶的攻擊, 有利於防止自身膜蛋白的降解。

?溶酶體膜含有較高的膽固醇, 促進了膜結構的穩定。