《侍神令》根據《陰陽師》改編而來，講述了穿行於人妖兩界的陰陽師晴明，與眾妖締結契約，完成守護世界的使命。

在《陰陽師》中，妖怪被設定成反派系統角色，而陰陽師的主要工作就是制服妖怪，除了消滅，還可以收服，這稱為“式神”也叫“侍神”。

當“式神”與主人以名字簽下契約時，便定下與主人同生共死的盟誓，用生命捍衛自己的約定。

穿行於人妖兩界的陰陽師晴明，因與一眾妖怪締結契約，釀成大禍，深陷危機。而與此同時，妖皇勢力正捲土重來，一場惡戰一觸即發。在風雲突變、局勢動盪的危急時刻，晴明恍然發現，自己人妖混血的身份，竟是這一切災禍的關鍵......

電影《侍神令》結局：人與妖原本和平相處，相柳自稱妖皇蠱惑群妖屠殺人類，塗炭生靈，人界術士成立陰陽寮奮力反抗，誅殺相柳，將眾妖趕入妖界，從此涇渭分明。如有小妖混跡於人界，或當場被誅殺，或被封印於陰陽寮，永世不得自由。相柳雖死，但精神不滅，後凝聚成鱗石被封印於陰陽寮。陰陽師晴明集人、妖血脈於一體，時常經受相柳精神蠱惑，勾起妖性。晴明被同僚排擠，幸得師兄慈沐照顧，又與百旎締結侍神契約，永不背叛。

晴明釋放妖力，重獲新生，輕易將慈沐斬殺。慈沐消散於天地之間，被其妖力束縛的百旎也得以恢復神志。經此一事，百旎希望晴明與她一同回到陰陽寮，可晴明已成妖身，再難回頭，將鱗石捏碎銷燬，轉身與眾妖撤回妖界。

穿行於人妖兩界的陰陽師晴明（陳坤 飾），因與一眾妖怪締結契約，釀成大禍，深陷危機。而與此同時，妖皇勢力正捲土重來，一場惡戰一觸即發。在風雲突變、局勢動盪的危急時刻，晴明恍然發現，自己人妖混血的身份，竟是這一切災禍的關鍵。